美国冷泉港实验室科学家开发了世界上第一款基于苹果操作系统的移动式基因组序列分析程序,用苹果手机配上手持式DNA测序仪,就可创建一个移动式遗传学实验室。这使人不禁想起美剧《星际迷航》中的“三录仪”。
斯波克队长的体检三录仪曾给《星际迷航》的影迷留下深刻印象,这也是人们对未来医疗幻想的象征。剧中的三录仪让医生无论是在飞船上还是在外星球执行任务时,可以随时评估一个人的医疗状况,让他能够快速、轻松地做无创诊断。
随着测序仪的不断缩小,目前尚无可在移动设备上研究DNA的技术。大多数DNA研究,如比对和分析工作,都是在大型服务器或高端笔记本电脑上进行的。而研究流行疾病的科学家必须在手提箱中满载测试仪、笔记本电脑和其他工具,才能在偏远地区进行分析。
冷泉港实验室开发的iGenomics应用程序可完全在苹果手机上运行,减少了在现场对笔记本电脑或大型设备的需求,这对流行疾病和生态工作者非常有用。应用程序的开发是对牛津纳米孔公司生产的微型DNA测序设备的补充。
该项研究发表在《Gigascience》上,论文中指出, iGenomics算法可快速定位病毒病原体(如流感病毒或寨卡病毒)的DNA序列,并识别出对诊断和治疗很重要的突变。研究人员还提供了在线教程,以分析其他病毒基因组,如来自新冠肺炎患者的基因组。
iGenomics使基因组研究变得便携化、可访问且负担得起。用户可通过苹果操作系统的应用程序相互传送测序数据,从而在最遥远的地方,甚至那些无法访问互联网的地方进行DNA分析。研究人员介绍,iGenomics可能很快就会送到宇航员手中,在太空中进行DNA测序。
研究人员表示,最新智能手机已相当于一部专业相机,不难想象在接下来的几年里,智能手机也可以是一部便携式DNA测序仪。带上一部手机,检测环境、寻找病原体甚至扫描人体发现病情,都将不再是科幻剧情。(记者 冯卫东)
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