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第四范式生物药物计算成果再次登上《Nature》子刊

第四范式生物药物计算成果再次登上《Nature》子刊
2023-12-21 14:50:35 来源:中国网

12月20日晚,国际顶级学术期刊《Nature》旗下子刊《Nature Computational Science》发表了第四范式(第一完成单位)在生物计算领域最新的研究成果。该论文采用了人工智能与生物网络相结合的方法,精准预测联合用药后在疗效、耐药、不良反应等方面的表现,可为临床治疗和新型药物研发提供重要科学依据。这也是《Nature》系列期刊第二次刊登第四范式相关研究成果。

《Nature Computational Science》是专注于基础和应用计算科学的《Nature》期刊,侧重于计算技术和数学模型的开发与使用,以解决一系列科学学科中的复杂问题。该期刊以收录论文“量少质高”著称,发表的论文极具科研及应用价值。

联合用药是临床最普遍且有效的治疗方式之一,具有增强疗效、减少毒副作用和缩短疗程等优点,但同时也伴随着药物相互作用引起的不良反应等不确定因素。因此,多重用药副作用的预测和发现,对改善患者用药护理和新型药物研发均起着至关重要的作用。

为了提升新型药物相互作用的推理效果,第四范式提出利用生物网络进行知识补全。生物网络是一种有向多关系图,包含诸如基因、疾病、药物等生物网络的丰富生物知识,可以为新药提供有效的辅助信息。此外,为解决生物网络中大量无声、噪音问题,第四范式利用基于路径子图的注意力机制,挖掘联通新药和已知药物的重要链接路径,从而实现对新型药物相互作用的有效推理。

相比传统基于特征的药物作用推理和基于深度学的预测算法利用生物网络的EmerGNN算法对于各类型的药物作用预测均能起到约10%的准确率提升,同时可通过挖掘出的路径起到解释预测结果的作用。

除此之外,该成果还可被广泛应用到其他生物医药领域,例如药物靶向预测、蛋白质相互作用预测等。

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责任编辑:kj005

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