Agilent Avida 最新目录化产品
7月份,Avida在国内重磅上市:
作为一个创新型的靶标富集解决方案,Avida以其独特的探针体系和创新的杂交化学体系、捕获工作流程,可实现在同一靶向序列捕获工作流程中实现 DNA 和甲基化的分析;具有样本起始量低、周转快、保真度高等特点,Avida高性能工作流程提供了多组学的分析能力,适用于肿瘤基础研究、肿瘤早筛、MRD等领域的科研与产品开发需求。
10月,Avida迎来重大更新:
1、第三款 DNA Panel,内容更丰富:
在DNA focused panel(14基因),DNA expanded panel(105基因)之外,安捷伦正式推出第三款DNA panel:DNA Discovery Panel,其包含682gene,大小为2.7Mb;对cfDNA样本而言,最小推荐测序量为200M PE reads,测序成本更低,可以覆盖的变异类型为 SNP, Translocation 与 CNV;该panel可以单独使用,也可以搭配Avida 甲基化panel以同时检测突变与甲基化信息;并同样适用于安捷伦自动化文库构建平台,将用于液体活检样本中生物标志物的探索。
优异的on-target和mapped reads:测试样本为人类cfDNA标准品,测序数据量为50M PE 2×150 reads,取4次重复实验的平均值,显示Avida DNA Discovery panel测序效率更高,且在3ng与10ng投入量下,其on-target和mapped reads一致;
2、突变、甲基化生信分析指南,同时发布:
为方便用户更快速上手,安捷伦官方提供了针对突变分析、甲基化分析的生物信息指南;该指南详细描述了每个生物信息分析关键步骤的过程、软件选择、参数调教,帮助您更快上手,在您的实验室准确复现Avida高性能表现。
结合用户反馈和样本实测经验,该分析指南也将不断推出新版本以供参考;
Avida DNA analysis pipeline
3、定制化上线, 选择更灵活:
在目录化产品之外,安捷伦已开放基于在线工具SureDesign进行DNA panel、Methyl panel的个性化定制.
Avida 个性化设计可针对覆盖完整性或测序效率进行优化,即包含两种设计策略:“Avida All Probes”包含了一些基因组重复区域,可确保全面覆盖,相比之下,“Avida High Quality Probes”则排除了这些区域,以提高测序效率;使用这两种不同的设计策略,我们设计并测试了378 kb 和 879 kb panel的表现,理论覆盖率分别为 1600 X和 850 X;
比较 Agilent Avida all probes和 Agilent Avida high quality probes两种设计方法在两个不同panel上的性能指标。
这种个性化设计的灵活性与 Avida全套工作流程所提供的洞察力,使定制的实验设计,得以灵活解决多组学前沿问题。
安捷伦Avida 的不同工作流程,已经在国内多家临检和科研实验室进行FFPE样本、cfDNA样本的上机测试,相关测试数据、用户案例将陆续发布,敬请期待!
关于安捷伦科技
安捷伦科技有限公司(纽约证交所:A)是分析与临床实验室技术领域的全球领导者,致力于为提升人类生活品质提供敏锐洞察和创新经验。安捷伦的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。2023财年,安捷伦的营业收入为68.3亿美元,全球员工数为18,000人。
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