小熊猫生物于近日发布全新的蛋白质工程云端实验服务,这项服务也将成为其正在建立的「生物编程技术平台」中的重要部分,推动生物科技行业技术发展。蛋白质工程云服务,整合了蛋白质结构预测与设计、超高通量实验测试、自动化机器学习、专有的蛋白表达系统和蛋白生产纯化工艺等多种能力,可以让蛋白质产品的开发者,足不出户,进行新型蛋白质开发、性能优化到规模化生产的全流程。
蛋白质是生命系统中实现功能的主要承担者。这里面有提供力学结构支撑的胶原蛋白,能够完成特异性相互识别的抗原抗体,赋予神经元火花的离子通道,催化各种复杂生化反应的生物酶系统……人类对蛋白质进行工程改造和生产的能力,正在重塑我们生活的世界,已经在医药、食品、消费品、农业等多个领域改变了人们的日常生活。定制的重组抗体被广泛地应用在检测试剂盒中,添加多种酶制剂的洗衣粉在帮助家家户户处理难除污渍,植物源的血红蛋白可以为各类豆制品提供风味、做成植物肉,各种生物催化剂也已经在化工厂中逐步替代高污染的传统方案。
我们相信,还有大量尚未被解决的应用问题,能够利用蛋白质给出低碳、高效的生物学方案。然而,开发蛋白质产品目前仍然是一个复杂且耗时的过程。从发现、设计新的蛋白质,功能测试和性能优化,一直到工业化生产,都存在一定的技术挑战。这些挑战往往是复杂耦合的,高度依赖经验和资本投入,存在研发周期久、规模化困难、失败率高等诸多问题。
为解决这一困境,小熊猫生物推出“端到端”的蛋白质工程云服务。这样,针对用户的终端需求,蛋白质结构预测、机器学习指导的序列设计、生产菌株开发、规模化量产等多个技术模块可以实现全局最优化,为蛋白产品从概念到市场验证提供一条快车道。
具体服务模块包括:
AI辅助蛋白质发现和设计:
• 利用实验数据标记和深度学习算法构建的蛋白功能数据库,发现新蛋白和潜在的功能蛋白
• 使用Ailurus Fold,利用深度学习算法对目标蛋白的结构、功能和稳定性进行高通量预测以及序列优化
基于超高通量测试和海量元件,进行数据驱动型研发:
• 20,000+种工程底盘、1000+亿种Ailurus vec®️表达载体,超高通量随机筛选,刻画蛋白质表达特性
• 使用1200+种连接linker,连接19000+种蛋白质结构域,组装海量融合蛋白,深入挖掘新功能
• 超高通量实验数据,搭配自动化机器学习和预训练模型,快速定制“序列-功能”优化算法
大规模蛋白质生产制备:
• 使用小熊猫人工菌种底盘,包涵体、二硫键等问题的解决「插件」即插即用
• 数据驱动的放大生产工艺,灵活支持从1 mL到100 L的生产规模
• 采用PandaPure®️纯化工艺,一步到位生产无标签蛋白
小熊猫生物将为医药、消费品、环境、人工智能等多个领域的合作伙伴提供蛋白质工程云服务,支持全新产品和业务管线的研发,让消费品市场用上安全易得的甜味剂,让抗生素能以每年一代的速度更新,让重组蛋白质药物能快速跨过临床前研究,让新的可降解材料能够拥有多样的颜色和性能。我们将在项目的第一阶段,为用户提供详尽的科学研究报告或产研报告;并在第二阶段,为经济上可行的蛋白质产品提供相应的生产产能。
在小熊猫生物,我们一直致力于不断开发、改进我们的平台,让生物编程能够像电子计算机编程一样简单、高效,让生物科技领域能像今天的IT工业一样高速增长。基于国际领先的生物编程、自动化、计算生物学和蛋白生产能力,我们期待能与合作伙伴们,全面加速以蛋白质为核心的各类产品的开发和落地。
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